記者從中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng )新中心獲悉，該中心韓斌院士團隊通過(guò)研究，首次完成了145份亞洲栽培稻及其普通野生稻的高精度基因組組裝，繪制了迄今為止分辨率最高的“野生稻-栽培稻泛基因組圖譜”，系統挖掘了普通野生稻廣泛的遺傳多樣性，并全面解析了亞洲栽培稻各類(lèi)群的進(jìn)化及馴化路線(xiàn)。這項研究為水稻基因組輔助育種提供了前所未有的遺傳資源，為培育抗病耐逆、適應氣候變化的優(yōu)質(zhì)水稻品種奠定了堅實(shí)的科學(xué)基礎。該科研成果于北京時(shí)間4月16日在國際學(xué)術(shù)期刊《自然》（Nature）在線(xiàn)發(fā)表。

　　亞洲栽培稻是全球數十億人的主糧，其馴化歷史可追溯至一萬(wàn)年前的普通野生稻。面對全球人口增長(cháng)和氣候變化加劇的雙重壓力，如何將野生稻歷經(jīng)萬(wàn)年錘煉的“生存智慧”注入現代品種，培育出兼具高產(chǎn)潛力與抗病抗逆特性的“超級水稻”已成為破解糧食安全困局的重大課題。然而，傳統依賴(lài)單一參考基因組的研究模式僅能捕捉水稻遺傳多樣性的冰山一角。因此，需要構建一個(gè)高質(zhì)量、大規模的野生稻泛基因組，深度解析其廣泛的多樣性，全面挖掘其耐逆、抗病等優(yōu)良性狀的遺傳變異寶庫。

　　中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng )新中心韓斌研究團隊整合具有代表性的129份普通野生稻和16份亞洲栽培稻資源，進(jìn)行高質(zhì)量的基因組測序和從頭組裝，構建了一個(gè)可以覆蓋野生稻和栽培稻全面遺傳景觀(guān)的泛基因組圖譜。這也是該研究團隊繼全面解析水稻馴化路線(xiàn)和構建首個(gè)栽培稻-野生稻泛基因組草圖之后，在水稻基因組研究和進(jìn)化領(lǐng)域取得的又一項重大突破。

　　這一參考基因組級別的栽培稻-野生稻泛基因組為原有公認的單個(gè)參考基因組新增了38.7億個(gè)堿基對，包含69531個(gè)基因，其中近20%為野生稻特有的，這些基因被證實(shí)與抗病防御、環(huán)境適應性等性狀密切相關(guān)。研究發(fā)現，野生稻中的抗病基因豐度和多樣性均明顯高于栽培稻，已精準定位到1184個(gè)野生稻中拷貝數高于栽培稻的抗病基因位點(diǎn)，其中包含2個(gè)已驗證的抗稻瘟病基因。這些發(fā)現進(jìn)一步證實(shí)了野生稻堪稱(chēng)作物改良的“戰略資源庫”，可以為培育抗病耐逆的水稻品種提供直接的基因來(lái)源。

　　基于高質(zhì)量的基因組序列，對亞洲栽培稻各類(lèi)群中的早期關(guān)鍵馴化基因進(jìn)行單倍型分析，證明所有亞洲栽培稻的馴化位點(diǎn)均來(lái)源于粳稻祖先Or-IIIa，進(jìn)一步證實(shí)了亞洲栽培稻單起源假說(shuō)，為持續數十年的學(xué)術(shù)爭議提供了關(guān)鍵證據。此外，研究還發(fā)現在南亞各栽培稻類(lèi)群之間存在廣泛的基因交流，并由此定義了一個(gè)新的栽培稻亞群intro-indica，成功繪制了一幅全面的水稻進(jìn)化和馴化路線(xiàn)圖。

　　綜上所述，這項研究構建了一個(gè)近飽和的野生稻泛基因組數據庫，實(shí)現了野生稻遺傳資源的系統性整合，有效彌合了野生稻和栽培稻基因組學(xué)研究的差距?？茖W(xué)家可據此精準挖掘野生稻優(yōu)勢等位基因，追溯重要基因的起源，解析水稻環(huán)境適應與表型可塑性機制。在糧食安全日益嚴峻的當下，這項研究為實(shí)現水稻快速從頭馴化、精準培育抗逆性強、資源利用率高、產(chǎn)量突破的新品種提供了關(guān)鍵的基因資源。

　?。偱_央視記者 帥俊全 褚爾嘉）